Sektor peternakan rakyat di Desa Gondowido dikembangkan secara berkelanjutan dan ramah lingkungan melalui program kelompok peternak desa. Komoditas unggulan meliputi budidaya Kambing Peranakan Etawa (PE) dan kambing Jawa Randu yang menghasilkan daging berkualitas serta produksi susu kambing segar kaya nutrisi.

Di samping ternak kambing, warga aktif membudidayakan Ayam Kampung Super (Joper) dengan sistem pakan fermentasi berbasis hijauan lokal lereng pegunungan. Usaha peternakan ini menjadi motor penggerak ketahanan pangan desa, menciptakan lapangan kerja bagi generasi muda desa, serta memenuhi suplai bahan pangan segar untuk restoran dan warung kuliner di kawasan wisata Ngebel.